修文歷史悠久，春秋時期屬牂牁地，唐朝時期分屬功州和蠻州。元世祖至元二十年(1283)，四川行省討平九溪十八洞后置順元等路軍民安撫司，立總管府，聽順元路宣慰司節制。安撫司領貴州等處長官司24個，其中置于息烽縣和修文縣地的有青山遠地等處、底寨等處、落邦扎佐等處和六廣等處4個蠻夷長官司，隸四川行省。二十九年改隸湖廣行省。
明洪武五年(1372)，縣地蠻夷長官司長官內附，改置為青山長官司、底寨長官司和扎佐長官司，復隸四川行省；同時，裁六廣等處蠻夷長官司，將其地歸入貴州宣慰使靄翠親領水西地，屬于的則溪地屬的龍爾(今龍場)、底飛(今六廣)2目。明洪武十七年（1375），貴州宣慰使奢香開龍場九驛，其中坐落在今縣境的有龍場驛和六廣驛。永樂十一年(1413)置貴州行省，縣境各長官司即屬貴州節制。
崇禎三年(1630)置敷勇衛。以貴州宣慰司安氏親領之龍爾地置衛城和衛直轄地，衛指揮使司設其間；以底飛地置濯靈守御千戶所，治地六廣城；廢扎佐長官司，以其地置修文守御千戶所，治地扎佐城；廢青山長官司，以其地置于襄守御千戶所，治地九莊城；以貴州前衛故絕六屯地及底寨長官司部分地置息烽守御千戶所，治地息烽城。底寨長官司和底寨副長官司繼續保留。
清康熙二十六年(1687)，裁敷勇衛置修文縣，隸屬貴陽府。改衛城為縣城。將全縣劃為至孝、崇義、信順和仁和4個里，下轄32甲、207個村寨。置縣之后，仍保留底寨正、副長官司，至道光年間裁廢，轄地劃歸仁和里。光緒三十一年(1905)，貴陽府將甌脫地養龍司5個保和麥西里屬地安馬莊撥歸修文縣管轄。
民國3年(1914)8月，經內務部呈大總統核準，劃修文縣仁和里全境、信順里5個甲和崇義里3個甲，以及貴陽、紫江(今開陽)部分地置息烽縣。4年(1915)，由息烽、修文和貴陽等縣知事實地踏勘劃定縣界。縣界基本固定，隸屬黔中道，全縣劃分為7區、47保、235個甲，共有524個村寨。民國9年，裁黔中道，隸屬貴州省。民國21年，區以下廢保置鄉(鎮)，全縣建10個鎮和60個鄉。區改以序號名區，即中南區為第一區，中北區為第二區，東區為第三區，南區為第四區，西區為第五區，北一區為第六區，北二區為第七區。
民國24年(1935)，廢鄉(鎮)，置聯保，縣改隸貴州省第一行政督察區。26年，縣隸省直轄區。27年調整區劃，全縣調為6個區，將第一區改為直轄區，第二區改為第一區，第五區改為第二區，第三區和第四區不變，第六區、第七區合并為第五區。區下置25個聯保，聯保下置133個保。民國30年，縣復直隸省。31年推行新縣制，撤銷區和聯保復置鄉(鎮)，下轄保、甲。自此，全縣行政區劃共劃為2個鎮和11個鄉、126個保、1069個甲。至38年(1949)9月，全縣計有13個鄉(鎮)126個保，1053個甲。
1949年11月17日，修文縣解放。11月24日，建立縣人民政府，全縣置烏栗、扎佐、石安和六廣4個區，轄13個鄉(鎮)，縣隸屬貴陽專區。次年4月，烏栗區政府遷駐縣城，改稱城關區。8月按序號名區，城關區改稱第一區，扎佐區改稱第二區，石安區改稱第三區，六廣區改稱第四區。1952年4月，第三區遷駐久長，并于小箐增設第四區，改第四區為第五區。縮小鄉的規模，將全縣調為5個區，轄2個鎮和31個鄉。11月19日，縣改隸貴定專區。
1955年11月，復按地名稱區，即第一區稱城關區，第二區稱扎佐區，第三區稱久長區，第四區稱小箐區，第五區稱六廣區。1956年2月，全縣劃為2個鎮和46個鄉。4月18日縣改隸安順專區。是年6月，裁撤小箐區，所轄各鄉納入久長區。8月，全縣劃為4個區，轄2個鎮、28個鄉建制。1957年7月，城關鎮和扎佐鎮升格為區級鎮，全縣劃為4個區和2個鎮、28個鄉。
1958年9月，大辦人民公社，取消區、鄉建制，全縣建“政社合一”的人民公社9個，12月改建為8個人民公社，轄29個管理區。管理區下置176個生產隊、897個生產小隊。是年12月29日，縣改隸貴陽市。1961年6月，貫徹中共中央調整方針，恢復區的建置，改管理區為公社，生產隊改稱生產大隊，生產小隊改稱生產隊。全縣復置5個區，區以下置30個公社、230個生產大隊、1321個生產隊。
1962年4月，撤銷久長、小箐兩區，將原久長區的石安公社和馬官公社并入陽明公社后劃屬城關區，金橋、清水公社并入久長公社后隸屬扎佐區；將原小箐區的崇恩公社劃屬城關區，灑坪并入小箐公社后，連同馬場、中寨公社劃屬六廣區；將城關區的新場公社并入谷堡公社，增置水塘公社隸城關區；將三元公社并入扎佐公社仍屬扎佐區；將六廣區的紅巖并入大石公社和花榔、涼井、寶寨并入六桶公社后仍歸六廣區。全縣共有3個區21個公社。公社下置229個生產大隊、1353個生產隊。是年10月，恢復城關鎮建制。1963年3月，扎佐公社析為扎佐鎮和高潮公社，全縣調為5個區，轄2個鎮和29個公社、226個大隊、1339個生產隊。6月，城關區增加新場公社；10月，六廣區增加紅巖公社。21日縣改隸安順專區。至1965年11月，全縣共有5個區，轄2個鎮和31個公社、228個生產大隊、1356個生產隊。
1966年5月進行撤區試點，裁久長區，將原區屬久長、金橋、清水3個公社合并為久長公社，直隸于縣；將石安公社劃屬城關區轄；將馬官公社和水塘公社的程官、青龍2個大隊并入陽明公社后改稱馬家橋公社；并將水塘公社之水塘大隊劃屬三元公社；高倉、小山、水竹和羅家寨大隊劃屬王官公社；將扎佐鎮、高潮公社和三元公社之磨盤寨生產隊合并為扎佐公社。全縣為4個區，轄1個鎮和27個公社(含久長直屬公社)、206個大隊、1110個生產隊。
1981年1月，撤久長直屬公社復置久長區，由扎佐公社析出扎佐集鎮部分恢復扎佐鎮建制，全縣調為5個區，轄2個鎮、30個公社、215個大隊、1739個生產隊。至1983年，大隊增為217個，生產隊減為1668個，并有12個居民委員會。
1984年4月，取消公社建制，實行政、社分設，復建鄉(鎮)、村政權，鄉(鎮)轄村民委員會(居民委員會)，村以下建村民小組。全縣共建立5個區，轄2個鎮和30個鄉、217個村民委員會和12個居民委員會、1403個村民小組。5月，城關鎮升格為區級鎮。6月，改桃源鄉、大石鄉為大石布依族鄉。1985年9月，將久長鄉改為久長鎮，六廣鄉改為六廣鎮。至1990年，全縣共建5個區和1個區級鎮，轄28個鄉(其中布依族鄉2個)和3個鄉級鎮、217個村民委員會和12個居民委員會、1434個村民小組。1513個自然村寨。
1992年2月，將全縣5區32鄉(鎮)撤并為城關、扎佐、久長、六廣4個鎮和谷堡、六屯、小箐、灑坪、大石、六桶6個鄉，以體現“小政府，大服務”的特點。1996年1月，修文縣劃歸貴陽市管轄。1999年9月，城關鎮更名為龍場鎮。2003年10月，全縣撤居民段改置社區，龍場置龍崗、棲鳳、賓陽、虎山4個社區；六廣、小箐、久長鎮分別將原來的居委會改為社區；扎佐鎮原2個居委會改建為景陽和襄陽2個社區，2005年8月增設萬江社區。
2011年7月，龍崗社區服務中心掛牌成立。2012年8月修文縣珍珠河社區服務中心啟動。
2013年，修文縣開展撤鄉設鎮工作，六屯鄉、六桶鄉、灑坪鄉改為六屯鎮、六桶鎮、灑坪鎮，全縣共有10鄉(鎮)，113個行政村、12個居委會，1322個村民組。修文縣下設2個社區服務中心，分別為龍崗社區服務中心、珍珠河社區服務中心。2016年11月，龍場鎮城南村、城北村分別改為翠屏居委會、中山居委會，扎佐鎮紅橋村改為紅橋居委會，改屬珍珠河社區，新園村改為新園居委會，改屬珍珠河社區，久長鎮久長村改為青龍居委會，全縣轄108個行政村17個居委會。
2017年7月，撤銷谷堡鄉、小箐鄉設立谷堡鎮、小箐鎮。
2019年6月，龍崗社區服務中心在易地扶貧搬遷安置點成立龍潭居委會。
2020年5月，省人民政府批復同意撤銷龍場鎮、扎佐鎮、久長鎮、龍崗社區、珍珠河社區，設立龍場、陽明洞、扎佐、景陽、久長街道。
目前，全縣轄龍場、陽明洞、扎佐、景陽、久長5個街道，六廣、六屯、灑坪、六桶、谷堡、小箐鎮和大石布依族鄉7個鄉鎮，108個行政村，18個居委會，1253個村民小組，126個居民小組。
