紫云自治縣地處貴州高原向廣西丘陵過渡斜坡地帶的中低山盆谷區，其中山地占總面積的 77.8% 。境內地勢南北高而中部平緩，東西兩側向外傾斜，西部山脈屬烏蒙山系，其余為苗嶺山系。最高點馬鬃嶺海拔1681 米 ，最低點喜翁河出口處海拔 623 米 ，平均海拔在 1000 -1300 米 。